Jefatura de la Oficina de la Gubernatura del Estado

1. Instituto Morelense de Radio y Televisión.

Secretaría de Gobierno

1. Instituto de la Defensoría Pública del Estado de Morelos.
2. Instituto de Servicios Registrales y Catastrales del Estado de Morelos.
3. Instituto Pro Veteranos de la Revolución del Sur.
4. Coordinación Estatal de Protección Civil Morelos.
5. Comisión Ejecutiva de Atención y Reparación de Víctimas del Estado de Morelos.

Secretaría de Hacienda

1. Instituto de Crédito para los Trabajadores al Servicio del Gobierno del Estado de Morelos.
2. Fideicomiso de Certificados de Participación Ordinarios (sin operación).

Secretaría de Desarrollo Económico y del Trabajo

1. Instituto Morelense para el Financiamiento del Sector Productivo o Fondo Morelos.
2. Comisión Estatal de Mejora Regulatoria.
3. Instituto de Capacitación para el Trabajo del Estado de Morelos.
4. Consejo de Ciencia y Tecnología del Estado de Morelos.
5. Fideicomiso del Fondo de Desarrollo Empresarial y Promoción de la Inversión.
6. Fideicomiso Parque Científico y Tecnológico Morelos.
7. Fideicomiso del Fondo de Competitividad y Promoción del Empleo.
8. Aeropuerto de Cuernavaca, S.A. de C.V.

Secretaría de Desarrollo Agropecuario

1. Fondo de Fomento Agropecuario (FOFAE).
2. Fideicomiso de Impulso Financiero al Campo Morelense (FIFCAM).

Secretaría de Educación

1. Colegio de Bachilleres del Estado de Morelos.
2. Colegio Nacional de Educación Profesional Técnica del Estado de Morelos.
3. Colegio del Estudios Científicos y Tecnológicos del Estado de Morelos.
4. Instituto Estatal de Educación para Adultos.
5. Universidad Politécnica del Estado de Morelos.
6. Universidad Tecnológica del Sur del Estado de Morelos.
7. Universidad Tecnológica “Emiliano Zapata” del Estado de Morelos.
8. Instituto de Educación Básica del Estado de Morelos.
9. Instituto Estatal de Infraestructura Educativa.
10. Instituto del Deporte y Cultura Física.

Secretaría de Salud

1. Régimen Estatal de Protección Social en Salud de Morelos (en proceso de extinción).
2. Servicios de Salud de Morelos.
3. Hospital del Niño Morelense.
4. Sistema para el Desarrollo Integral de la Familia del Estado de Morelos.
5. Comisión Estatal de Arbitraje Médico.
6. Centro de Rehabilitación Integral Xoxotla (sin operación).

Secretaría de Turismo y Cultura

1. Museo Morelense de Arte Popular.
2. Centro Morelense de las